Sa création officielle est le fruit d’un long processus de construction collective et de structuration de la filière lait de brebis initié au début des années 2000. La production de lait de brebis, historiquement très localisée dans trois principaux bassins de production situés en Occitanie, dans les Pyrénées-Atlantiques et en Corse, était structurée au niveau régional, au travers de la Confédération Générale de Roquefort (CGR), de l’Interprofession lait de brebis des Pyrénées-Atlantiques (IP64) et de l’Interprofession Laitière Ovine et Caprine Corse (ILOCC).
Au début des années 2000, à l’initiative de l’ONILAIT qui deviendra ensuite FranceAgriMer, ces structures régionales, ainsi que le Comité National Brebis Laitières (CNBL), véritable bras technique de la filière lait de brebis, se rencontrent au sein du conseil spécialisé lait de brebis afin de se fédérer, de connaître et partager leurs spécificités et font émerger des projets communs autour des sujets portés par l‘ONILAIT (conjoncture et suivi économique, recherche et développement, appui technique, marchés…).